Miten eDNA-analyysi toimii? Näin Puro Analytics käyttää ympäristö-DNA:ta luonnon monimuotoisuuden selvittämisessä

Luonnon monimuotoisuuden eli biodiversiteetin seuranta ja raportointi on noussut nopeasti keskeiseksi osaksi sekä viranomaisten vaatimuksia että yritysten omaehtoisia tarkkailuohjelmia. Perinteiset menetelmät eivät enää yksinään riitä vastaamaan kasvaviin tietotarpeisiin. Ympäristö-DNA (eDNA) on teknologia, joka tarjoaa tähän ratkaisun tuomalla molekyylibiologisen seurannan osaksi luonnon tarkkailua.

Tässä blogissa avaamme, miksi eDNA on erinomainen työkalu nykyaikaisissa luontoselvityksissä ja kuinka me Puro Analyticsilla varmistamme, että saatavilla oleva data on hyödynnettävissä, oli sitten kyse yrityksen vapaaehtoisesta tarkkailusta tai viranomaisen velvoittamasta selvityksestä.

Miten eDNA täydentää perinteisiä menetelmiä ja mitä uutta se mahdollistaa?

Ympäristö-DNA-analytiikka perustuu siihen, että jokainen eliö jättää jälkeensä geneettistä materiaalia elinympäristöönsä. Kun tämä materiaali kerätään ja analysoidaan laboratoriossa, saamme kattavan kuvan alueen lajistosta ilman tarvetta nähdä tai pyydystää itse eliöitä.

Organisaatioille ja yrityksille eDNA-menetelmien hyödyntäminen tarkoittaa kolmea konkreettista etua, jotka täydentävät perinteisiä selvitysmenetelmiä sekä mahdollistavat uudenlaista biologista seurantaa:

• Kustannustehokkuus ja nopeus: Perinteisiin kenttätutkimuksiin verrattuna eDNA-testit ovat nopeampia ja usein edullisempia toteuttaa, mikä säästää resursseja ja mahdollistaa aiempaa laajempien selvitysten tekemisen.

• Tarkkuus ja herkkyys: Menetelmä paljastaa myös harvinaiset, vaikeasti havaittavat ja vaikeasti tunnistettavat lajit, jotka saattaisivat muuten jäädä huomaamatta tai tunnistamatta.

• Objektiivisuus ja toistettavuus: eDNA menetelmät tarjoavat objektiivisen ja toistettavan tavan kerätä tietoa luonnosta, mikä avaa mahdollisuuden luonnon monimuotoisuuden systemaattiseen seurantaan ja raportointiin pitkilläkin seurantajaksoilla.

Käyttökohteet: YVA-menettelyistä vesistöjen tarkkailuun ja ennallistamishankkeiden seurantaan

eDNA-menetelmät ovat kehittyneet viimeisten vuosikymmenten aikana valtavasti eteenpäin. Ympäristö-DNA ei ole enää pelkästään tutkimusyhteisön työkalu, vaan sitä hyödynnetään useissa eri sovelluksissa laajemmasta biodiversiteetin monitoroinnista yksittäisiin lajistoselvityksiin. Puro Analyticsin kehittämät ratkaisut soveltuvat erityisesti seuraaviin kriittisiin tarpeisiin:

1. Ympäristövaikutusten arviointi (YVA): YVA-prosessit vaativat usein kattavien luontoselvitysten toteuttamisen. Ympäristö-DNA:lla voimme vastata useisiin prosessin vaatimuksiin (esim. direktiivilajien kartoitus) tuottaen tarvittavan tiedot nopeasti, kustannustehokkaasti, luotettavasti ja joustavasti eri vuodenaikoina.

2. Vesistöjen ekologisen tilan luokittelu ja seuranta: Mallinnamme vesistöjen tilaa eDNA:lla, esimerkiksi pohjaeläinanalyysien avulla. Ympäristö-DNA:n avulla voidaan laskea perinteisiä pohjaeläinselvityksiä vastaavia indeksejä ja mittareita ja lisäksi paljon muuta. Yksittäisistä näytteistä tunnistetaan jopa satoja eliölajeja ja pohjaeläinten lisäksi voidaan kartoittaa esimerkiksi kalastoa ja piileviä.

3. Luonnonsuojelu ja biodiversiteetin hallinta: Autamme yrityksiä ja organisaatioita kartoittamaan ja seuraamaan omia vaikutuksiaan luonnon monimuotoisuuteen systemaattisesti. Tätä varten Puro Analytics on kehittänyt omia raportointityökaluja sekä visuaalisen online-dashboardin, josta tulosten seuranta ja tulkinta on helppoa ja intuitiivista. Vaikutuksia voidaan seurata ja todentaa myös alueilla, joissa uskotaan syntyvän positiivisia luontovaikutuksia, kuten ennallistamishankkeiden yhteydessä.

Puro Analytics yhdistää uusimmat akateemiset löydökset, hankkeiden suunnittelun, käytännön toteutuksen sekä raportoinnin asiakkaan vaatimusten mukaisesti

Vaikka eDNA-teknologia on lupaavaa, sen hyödyntäminen vaatii syvällistä osaamista sekä käytännön kokemusta hyvien tulosten takaamiseksi. Tuloksia voivat vääristää esimerkiksi näytteiden kontaminaatio, ekologisen kontekstin ymmärryksen puute tai viitetietokantojen riittämättömyys. Siksi kumppanin valinta on kriittistä.

Puro Analytics erottuu markkinoilla käyttämällä aina parhaita mahdollisia analyysimenetelmiä, jotka taklaavat alan yleisimmät haasteet. Toteutamme projektit nopeasti, kustannustehokkaasti sekä aina sovituissa raameissa. Prosessimme kattaa kaiken näytteenotosta laboratorioon sekä bioinformatiikasta loppuraporttiin ja tulosten tulkintaan:

1. Huipputarkka laboratorioanalyysi: Eristämme DNA-fragmentit ja sekvensoimme ne uusimmilla menetelmillä ja laitteilla. Protokollamme sisältää aina tarvittavat positiiviset ja negatiiviset kontrollit (myös kentällä) sekä muut tarvittavat laadunvarmistukseen liittyvät vaiheet.

2. Luotettava tunnistus: Vertaamme tuloksia laajoihin geneettisiin tietokantoihin, jotta lajitunnistus on mahdollisimman tarkka. Lisäksi biologimme kuratoi datan manuaalisesti, jolla varmistetaan laatu myös niissä tapauksissa, että referenssikirjastoissa on puutteita tai virheellisiä annotaatioita.

3. Selkeä ja visuaalinen raportointi: Emme toimita vain raakadataa, vaan jalostettua tietoa, joka tukee kestävää päätöksentekoa. Tarjoamme asiakkaillemme sekä kirjoitetun loppuraportin, että pääsyn Puro Analyticsin kehittämään dashboardiin.

Tulevaisuuden luontotyö tuottaa parempaa dataa pienemmillä kustannuksilla

Bioinformatiikan ja molekyylibiologisten menetelmien kehittyessä eDNA:n tarkkuus kasvaa ja käytettävyys paranee jatkuvasti. Puro Analytics on tämän kehityksen kärjessä ja kehitämmekin jatkuvasti toimintaamme ja testaamme uusia toimintatapoja rutiininomaisesti. Tavoitteenamme on tehdä biodiversiteetin seurannasta helpompaa, nopeampaa ja luotettavampaa sekä viranomaisille, maanomistajille että yrityksille.

Kun haluat varmistaa, että ympäristöselvityksesi perustuvat tutkittuun ja moderniin tieteeseen Puro Analytics on oikea kumppani.

Kiinnostuitko? Ota yhteyttä tiimiimme, niin kerromme, kuinka voimme räätälöidä eDNA-seurannan juuri teidän tarpeisiinne.